Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms