Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms