Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms