Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms