Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms