Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9J2

MRPL44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL44Q9H9J2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL44Q9H9J2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRPL44Q9H9J2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL44Q9H9J2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL44Q9H9J2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms