Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms