Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W1

MS4A6A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6AQ9H2W1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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MS4A6AQ9H2W1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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MS4A6AQ9H2W1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A6AQ9H2W1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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