Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTIF3Q9H2K0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTIF3Q9H2K0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms