Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms