Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms