Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP62CLQ9H1M0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms