Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIL1Q9H173 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms