Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms