Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCL11BQ9C0K0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms