Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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