Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms