Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms