Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms