Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
MCMBPQ9BTE3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCMBPQ9BTE3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms