Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms