Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSEN34Q9BSV6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms