Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms