Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms