Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms