Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms