Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPIFA3Q9BQP9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA3Q9BQP9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms