Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLF1Q9BQI6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms