Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA1CQ9BQE3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA1CQ9BQE3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms