Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMCHL2Q9BQD1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms