Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ15

NABP2, SOSS complex subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP2Q9BQ15 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NABP2Q9BQ15 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NABP2Q9BQ15 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NABP2Q9BQ15 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NABP2Q9BQ15 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NABP2Q9BQ15 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NABP2Q9BQ15 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NABP2Q9BQ15 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NABP2Q9BQ15 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NABP2Q9BQ15 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NABP2Q9BQ15 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NABP2Q9BQ15 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms