Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms