Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms