Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCZQ96LD1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCZQ96LD1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms