Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX27Q96L92 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX27Q96L92 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX27Q96L92 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX27Q96L92 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX27Q96L92 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX27Q96L92 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX27Q96L92 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms