Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
PGBD1Q96JS3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms