Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms