Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms