Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms