Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTP4Q969X6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms