Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFKQ969G6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms