Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms