Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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RABGGTAQ92696 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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RABGGTAQ92696 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABGGTAQ92696 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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