Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms