Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-3Q8TAU0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-3Q8TAU0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms