Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC112Q8NEF3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms