Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00301Q8NCQ3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms