Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H1FOOQ8IZA3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms