Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms