Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms